張獻忠、羅汝纔等人再次造反的訊息剛剛傳到北京後，左良玉的兵敗訊便接踵而至。

    崇禎當時便氣急敗壞，下令把五省總督熊文燦、河南總兵張任學革職查辦，總兵左良玉降三級戴罪立功。

    隨令各督、理分任責成，合力掃除，“立限十二月成功，否則延違一體參處。”

    崇禎十二年八月，四川巡撫傅宗龍傅宗龍抵京。接任兵部尚書。楊嗣昌移交部務後，上疏請罪。

    八月二十五日崇禎下旨，楊嗣昌被授予禮部兼兵部尚書、東閣大學士的官銜就任督師，簡稱督師閣部或閣部。

    督師平定流寇，並賜尚方寶劍。經過一番準備後，楊嗣昌於九月六日陛辭，當日平臺餞行時崇禎帝贈詩曰：“鹽梅今暫作干城，上/將威嚴細柳營。一掃寇氛從此靖，還期教養遂民生。”

    楊嗣昌聽罷，邊哭邊拜，隨後便離開京師，踏上了這條不歸之路。

    楊嗣昌的出任督師以後，表面上氣派很大，可實際上也並沒有什麼良謀奇策，不過按照崇禎的剿撫兼用的“密諭”行事而已。

    他本人則不斷的調兵遣將，一心想消滅張獻忠等部，而對於包括羅汝纔在內的其他各支流寇則儘量施展招降詭計，妄圖分化瓦解。

    爲了達到儘快剿滅張獻忠，楊嗣昌認為必需要集中兵力，改變過去那種進止不一的局面。

    因此，他在便上疏，建議任命總兵左良玉為“大將”，掛“平賊將軍印”，賦予指揮其他參與鎮壓流寇的各鎮總兵的權力。

    他摺子中說道：“必立大將一員，總統諸部，聽其指麾，共臣謀畫，轉行排程，而後以威眾則無不服，以用眾則無不調，以殺賊則罔不摧，以平賊則罔不效。臣之不材，不敢方古裴度，而行間李愬，則良玉亦或庶幾。”

    楊嗣昌推薦左良玉為大將也是經過深思熟慮的，儘管自己位高勢重，但畢竟是文官，爲了有效的防止武將跋扈，排程不靈，需要籠絡一員實力最強的將領充當打手。

    而左良玉所部則算的上，在當時各路步兵中，算是比較能打仗，資歷、聲望也比較高。

    楊嗣昌希望透過這種破格重用，使左良玉感激涕零，從而拼死用命，同時依靠左部兵力挾制其他將領。

    而由於左良玉在之前的圍剿當中，丟失了總兵關防，成了無印之官。

    楊嗣昌從而向崇禎建議，把藏在內府的“平賊將軍印”給左良玉，並賜給敕書一道，明確規定左良玉的許可權。崇禎對楊嗣昌的建議那是言聽計從，一一覈准。

    在部署軍事圍剿的同時，楊嗣昌還展開了一場政治攻勢。

    他在爲了分化其內部，在各地榜懸賞通緝張獻忠，榜文上畫着張獻忠的頭像，書《西江月》一首，詞雲：

    “此是谷城叛賊，而今狗命垂亡。興安、平利走四方，四下天兵趕上。逃去改名換姓，單身黑衣逃藏。軍民人等綁來降，玉帶錦衣升賞。”

    榜尾還格外註明了，言其：“能擒張獻忠者賞萬金，爵通侯。”

    榜文在湖北、河南、陝西、四川等地到處張貼，張獻忠聽到以後，對著身邊眾寇將笑道：“營中有獲嗣昌者賞銀三錢。”